根据最新的排名信息，上海市大学排名100强中，前三位的高校分别是：
1. 复旦大学
2. 上海交通大学
3. 同济大学
这三所大学均属于985、211工程，并且是双一流大学建设之世界一流大学建设A类高校。
其他进入排名前列的高校还包括：
华东师范大学
上海财经大学
上海科技大学
上海外国语大学
东华大学
海军军医大学
上海大学
华东理工大学
请注意，排名可能会随着时间和不同评价机构的标准有所变化，以上信息以最新发布的排名为准。
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